Als wichtiger zusätzlicher Schritt zur Stärkung des Zusammenhangs des DZL-Forschungsportfolios wird seit 2021 ein neues übergreifendes Instrument, genannt "Arbeitsgruppen in krankheitsübergreifenden Forschungsfeldern" (Disease-spanning Working Groups, DSWG), installiert. Ähnlich wie bei den DZL-Plattformen arbeiten unsere Wissenschaftler und Ärzte aus allen Krankheitsbereichen unter dem Dach dieses neuen Instruments zusammen. Im Gegensatz zu den Plattformen konzentrieren sich die Arbeitsgruppen nicht auf methodische/technische Aspekte, sondern befassen sich mit aktuellen Forschungsthemen, die für die meisten, wenn nicht alle Krankheitsbereiche relevant sind. Ab 2024 wird die Förderung von Forschungsaktivitäten der vier DZL DSWG kompetitiv vergeben. Es werden Projekte gefördert, die mehrere Krankheitsbereiche und mehrere DZL-Standorte umfassen. Den fünf Standorten werden insgesamt 1,5 Millionen Euro pro Jahr zugewiesen sein.
Es bestehen Arbeitsgruppen zu den folgenden vier Themen: